Eine Krypta (von lateinisch crypta „Gewölbe“) ist eine Steinkammer unter dem Fußboden einer Kirche oder eines anderen Gebäudes. Sie enthält in der Regel Särge, Sarkophage oder religiöse Reliquien.
Ursprünglich wurden Krypten typischerweise unter der Hauptapsis einer Kirche gefunden, wie z.B. in der Abtei Saint-Germain en Auxerre, aber später auch unter dem Chor, den Kirchenschiffen und Querschiffen. Gelegentlich wurden Kirchen hochgezogen, um eine Krypta im Erdgeschoss unterzubringen, wie z.B. die St. Michaeliskirche in Hildesheim.